Cuando la huérfana Mary Lennox llega a vivir a la gran casa de su tío en Yorkshire Moors, la encuentra llena de secretos. La mansión tiene casi cien habitaciones y su tío se mantiene encerrado en una de ellas. En la noche, se escucha el sonido de un llanto por uno de los largos pasillos. Los jardines que rodean la gran propiedad son el único escape de Mary. Entonces, la niña descubre un jardín secreto, rodeado de muros y cerrado con una llave perdida. Con la ayuda de dos compañeros inesperados, Mary descubre una forma de entrar y se decide a devolver la vida al jardín.